സോണൽ തലം
ഓരോ ഡെപ്യൂട്ടി ഇൻസ്പെക്ടർ ജനറൽ ഓഫ് രജിസ്ട്രേഷന്റെയും നിയന്ത്രണത്തിൽ വകുപ്പിനെ നാല് സോണുകളായി തിരിച്ചിരിക്കുന്നു.

1. സൗത്ത് സോൺ: തിരുവനന്തപുരം, കൊല്ലം, പത്തനംതിട്ട ജില്ലകൾ. ആസ്ഥാനം തിരുവനന്തപുരം.

2. സൗത്ത് സെൻട്രൽ സോൺ: എറണാകുളം, കോട്ടയം, ഇടുക്കി, ആലപ്പുഴ ജില്ലകൾ. ആസ്ഥാനം എറണാകുളം

3. നോർത്ത് സെൻട്രൽ സോൺ: തൃശൂർ, പാലക്കാട്, മലപ്പുറം ജില്ലകൾ. ആസ്ഥാനം തൃശൂർ.

4. നോർത്ത് സോൺ: കോഴിക്കോട്, കണ്ണൂർ വയനാട്, കാസർഗോഡ് ജില്ലകൾ. ആസ്ഥാനം കോഴിക്കോട്.

ജില്ലാതലം
14 ജില്ലാ രജിസ്ട്രാർമാരും (ജനറൽ) 10 ജില്ലാ രജിസ്ട്രാർമാരും (ഓഡിറ്റ്) ഉണ്ട്. ജില്ലാ ഭരണം ജില്ലാ രജിസ്ട്രാർ (ജനറൽ) ആണ് നിർവഹിക്കുന്നത്, സബ് രജിസ്ട്രാർ ഓഫീസുകളുടെ ഓഡിറ്റിംഗ് ജില്ലാ രജിസ്ട്രാർ (ഓഡിറ്റ്) ആണ് നടത്തുന്നത്.